למכון התמחות ייחודית בטיפול להורים וילדים במשפחות עם קונפליקט הורי גבוה, במכון מומחים לתיאום הורי לשיפור תקשורת הורית לאחר גירושין, טיפול משולב הורים ילדים במצבי ניכור הורי וסרבנות קשר. מכון שלם משמש מומחה בבתי המשפט למשפחה ובתי הדין הרבניים להתערבות טיפולית במשפחות.